Na mocy umowy, UAM użycza około 1000 mkw. w budynku dawnego Collegium Historicum przy ul. Św. Marcin 78. Pomieszczenia znajdują na pierwszym piętrze budynku. Koncepcję ideową i użytkową Centrum Szyfrów ma przygotować krakowska firma New Amsterdam. Artyści z Krakowa od lat specjalizują się w budowaniu muzeów narracyjnych, czyli odwołujących się do emocji i wrażeń zmysłowych.
Zwiedzający będą mieli okazję zobaczyć ekspozycję poświęconą historii kryptologii oraz szyfrów. Muzeum ma mieć formę labiryntu. Goście będą mogli sami próbować łamać szyfry i sprawdzić swoją wiedzę w zakresie kryptologii.
W ramach Muzeum Enigmy planowane jest stworzenie ekspozycji stałej poświęconej historii kryptologii, enigmy oraz jej wpływu na współczesne rozwiązania cyfrowe. Ekspozycja zorganizowana zostanie w salach tematycznych zawierających zarówno materiały multimedialne, jak również stanowiska interaktywne. Sale nawiązywać mają do historii uniwersyteckiej oraz wkładu naukowego poznańskich kryptologów. W ramach muzeum planowane jest również prezentacja modelu enigmy pozwalająca zwiedzającym na poznanie podstaw jej funkcjonowania i sposobu szyfrowania wiadomości tekstowych. W ramach ekspozycji stałej ukazana zostanie historia działań wojennych oraz dziejów rozwoju nauk opartych na matematyce, w tym powiązań pomiędzy urządzeniami szyfrującymi a późniejszym rozwojem komputerów. Oprócz części zawierających informacje typowo historyczne, planowane jest stworzenie ekspozycji edukacyjnej, w szczególności dla dzieci, w której zwiedzający będą mogli bawić się odpowiednikami między innymi urządzeń deszyfrujących. Ekspozycja wzbogacona będzie o materiały filmowe oraz multimedialne.
Projekt jest elementem Traktu Cesarsko - Królewskiego w Poznaniu, który prowadzi od Ostrowa Tumskiego do dzielnicy Jeżyce. Muzeum Enigmy związane będzie bezpośrednio z poznańską dzielnica zamkową i będzie nawiązywał do historii tego obszaru.
Projekt będzie realizowany we współpracy z Uniwersytetem im. Adama Mickiewicza w Poznaniu oraz środowiskami społecznymi popularyzującymi historię polskiej myśli naukowej i technicznej.
