Ustawa z dnia 3 czerwca 2005 r. o zmianie ustawy - Prawo wodne oraz niektórych innych ustaw (Dz. U. Nr 130, poz. 1087) reguluje gospodarowanie wodami zgodnie z zasadą zrównoważonego rozwoju, a w szczególności kształtowanie i ochronę zasobów wodnych, korzystanie z wód oraz zarządzanie zasobami wodnymi.
Nowelizacja przedmiotowej ustawy wprowadziła zmiany dotyczące nowych pojęć, doprecyzowała zasady, na jakich odbywa się gospodarowanie poszczególnymi wodami, a także wprowadziła pełne przepisy regulujące procedurę oddawania w użytkowanie obwodu rybackiego.
Zgodnie z art. 1 ust. 1a - sprawy własności wód oraz gruntów pokrytych wodami, a także zasady gospodarowania tymi składnikami w odniesieniu do majątku Skarbu Państwa reguluje przedmiotowa ustawa. Dodano także ust. 4 o nastepującym brzmieniu: "Gospodarowanie wodami jest prowadzone w taki sposób, aby działając w zgodzie z interesem publicznym, nie dopuszczać do wystąpienia możliwego do uniknięcia pogorszenia ekologicznych funkcji wód oraz pogorszenia stanu ekosystemów lądowych i terenów podmokłych bezpośrednio zależnych od wód (art. 1 ust. 4).
Kolejne zmiany zawiera art. 5 ust. 3, przedstawiający podział wód śródlądowych na płynące, do których zalicza się wody:
oraz stojące, do których zalicza się wody znajdujące się w jeziorach oraz innych naturalnych zbiornikach wodnych niezwiązanych bezpośrednio, w sposób naturalny, z powierzchniowymi wodami płynącymi.
W art. 9 wprowadzono zmiany dotyczące definicji ścieków, m.in.bytowych, pod którymi rozumie się ścieki z budynków mieszkalnych, zamieszkania zbiorowego oraz użyteczności publicznej, powstające w wyniku ludzkiego metabolizmu lub funkcjonowania gospodarstw domowych oraz ścieki o zbliżonym składzie pochodzące z tych budynków. W przypadku pojęcia: urządzenia wodne, został wyszczególniony ich podział na:
Korzystanie z wód nie może powodować pogorszenia stanu wód i ekosystemów od nich zależnych, a także marnotrawstwa wody, marnotrawstwa energii wody, ani wyrządzać szkód (art. 31 ust. 2). Każdy zakład produkcyjny, który przyczynia się do wzrostu zanieczyszczenia wód, powinien liczyć się z tym, że będzie zobligowany do poniesienia części kosztów związanych z odprowadzonymi zanieczyszczeniami (art. 22 ust. 2).
Nowelizacja ustawy wprowadziła także cele środowiskowe (art. 38 ust. 2), a także uściśliła zasady gospodarowania poszczególnymi wodami, wg których np. do pobierania pożytków z wód w urządzeniu wodnym przeznaczonym do chowu lub hodowli ryb i usytuowanym na publicznych śródlądowych wodach powierzchniowych płynących jest uprawniony jego właściciel. Natomiast do pobierania pożytków, w drodze rybackiego korzystania z wód sztucznego zbiornika wodnego usytuowanego na publicznych śródlądowych wodach powierzchniowych płynących, jest uprawniony dyrektor regionalnego zarządu gospodarki wodnej (RZGW), w przypadku kiedy utrzymanie i gospodarowanie wodą w tym zbiorniku należy do jego zadań.
W nowej ustawie Prawo wodne uzupełniono kwestię oddawania w użytkowanie obwodu łowieckiego, które ma następować w drodze konkursu ofert, za opłatą roczną, na czas nie krótszy niż 10 lat, na podstawie umowy podpisanej przez dyrektora RZGW.